朱元璋传口谕，命朱棣即刻入宫。朱元璋给他看了一本账册，这次带空印表上来的人名都在上面，足足有一千七百多人，朱元璋叫朱棣过来，就是想问问他，该如何处置这些人。朱棣于是表示，对于贪污多的、官级大的，通通杀掉，至于那些胁从的，可以发配军流。朱标的意见与他不同，朱棣解释道，这一千七百多人，如若通通杀掉，其家眷也会被发配，大部分可能死在途中，算起来至少是几万条人命。
京中留守司来报，他们已经拿下永嘉侯父子，这是朱标下的令，他认为应当要对朝廷军贵有个震慑。明初，明太祖因官员空印贪墨，大举荡涤官场，连坐及军流者数以万计，此为明初之：空印案，而胡惟庸则成了君权与相权斗争的牺牲品。一干淮西公侯去求见韩国公，希望他能为淮西文武公侯多担待，韩国公没有见他们，但还是让吕大人帮忙，去狱中劝胡惟庸“上路”，给淮西文武公侯一条活路。
胡惟庸曾想过老相国会让谁来劝说自己上路，但他没想到是吕大人。胡惟庸虽说没有将来了，但吕大人用身后之名劝动了胡惟庸。吕大人走后，胡惟庸就让人拿来纸砚笔墨。写下一纸奏表，同时上交的还有各位王公从胡惟庸那里拿好处的账册记录。朱标看到后震惊不已，看来他把决定权交给了朱元璋，是对各公侯大动干戈，还是就此化了，全看朱元璋。这个胡惟庸非常聪明，朱元璋已经不能再给胡惟庸什么了，他决定赐胡惟庸自尽。
妙云再次晕倒，这个案子牵扯了太多了，总归是朱棣造成的杀孽，马皇后叮嘱他去惠济寺祈福。时间很快过去，足月的妙云生产，竟然是难产，不过好在妙云挺了过来，生下了二子朱高熙。此次案子造成了很多官员的空缺，吕大人负责吏部事宜，不得不采取措施广招士子任官。士子方孝孺携母进京，成为了礼部祠部主事。他谨奏要宽刑狱废苛法等举措，直指当朝三大弊政的一纸上书，彻底引爆了剑拔弩张的朝局，更把原来处在漩涡中的朱棣和锦衣卫，彻底推到了风口浪尖。
户部亦上书联署，铁铉亦跟随户部夏原吉夏大人，写上自己的名字。官员紧缺，朱元璋不得不让前朝进士，如今八十二岁的徐辉任户部尚书。老相国不忍见陛下如此为难，有重新入仕途的想法。张玉告诉朱棣，这次百官上奏，在陛下心中的分量要比上一次高出许多，毕竟这次弹劾锦衣卫的大多数是在空印案和胡逆案中全身而退的官员。朱棣没让他把这件事告诉妙云，但过去看生病的朱高炽时，还是看到了那本弹劾奏折。
在妙云的建议下，朱棣打算进宫让父皇和太子允许他卸下锦衣卫的差事，到北平就藩。方孝孺的父亲方克勤在济宁做过知府，因空印案受牵连而死。他来拿回父亲的灵柩，道衍和朱棣说方孝孺的身份。一场空印案，牵扯了太多人，即便是朱棣，也知道如今的大明，这根弦崩得太紧了。
