机器人梅身份暴露 纳迪尔财团浮出书面
菲尔把《黑暗之书》给了比利，希望比利能销毁书，博士通过机器人梅得知后，把此事告诉了纳迪尔议员，以期望能从纳迪尔议员处寻到保护。
在外休假的萨姆和比利突然遭到了袭击，他们尽力反抗，但是比利还是被纳迪尔议员的人带走了。萨姆根据线索找到了海边，但是依旧没有比利的身影，萨姆尽快联系了神盾局。
比利和真正的博士被带到了一艘潜水艇上，博士故意上演苦肉计，希望能打动比利，随后船长假装要刺破比利的眼球，博士看不下去，他只是想拿到《黑暗之书》，并不想真的伤害神盾局特工。
菲兹和迈克他们不断逼问机器人博士，但是机器人博士对真正博士的下落毫无头绪。菲兹想要进入机器人博士的编程，结果却发现编程比艾达那时候高级了很多，菲兹一时攻破不了。机器人博士用菲兹父亲和博士的曾经打击菲兹，菲兹不能面对，他拨掉了机器人博士的电源，原来菲兹父亲总是否定菲兹，并在菲兹十岁的时候抛弃了他然后下落不明。
黛西通过面部识别得知袭击局长的俄罗斯人和这次绑走比利的俄罗斯人都属于同一特种部队分部，因为俄罗斯首相曾经被异人攻击，所以俄罗斯人和纳迪尔议员联合起来，而《黑暗之书》有除掉异人族的办法，机器人梅趁机询问萨姆书的下落，萨姆只是说书很安全。
博士通过比利的记忆查看《黑暗之书》的下落，发现比利把书给了萨姆，但是萨姆告诉大家，他把书给了第一个凯尼格家族的特工LT，因为所有凯尼格特工的长相都是一模一样的，菲尔担心所有凯尼格特工的危险，他带领大家紧急保护LT。
LT和瑟斯顿在一个酒吧里，但是瑟斯顿和其他凯尼格特工不一样，他只是想过简单平凡的生活，因此对神盾局的到来很不爽。
这时，黛西查到了那些俄罗斯人受聘于安东.艾文诺夫，此人就是潜水艇上的船长。结果LT却说他们采取了“烫手山芋”活动，最终《黑暗之书》又回到了比利手上，比利把书放在了神盾局的迷宫密室乐山公共图书馆中，只有凯尼格特工家族知道迷宫的存在，另一边，博士通过比利的记忆也得知了这一切。
菲兹因为被父亲抛弃，被沃德背叛，现在又被博士利用，他很难过，西蒙斯为此去安慰他，菲兹从西蒙斯的话中获得灵感，他明白自己为什么破解不了机器人博士的代码，因为机器人博士的驱动来自大脑，而不是代码。菲兹检测机器人博士的大脑，他和西蒙斯想起博士曾经测绘过一个梅的大脑，他们和迈克明白原来梅才是那个机器人内鬼。
菲兹和机器人梅在等待萨姆取《黑暗之书》的时候，两个人之间的感情终于捅破了最后一层纸，菲兹和机器人梅接吻了。这时，LT说有三个全副武装的人带着比利过来了，萨姆把书给了机器人梅，机器人梅在程序的驱动下把枪对准了菲尔，黛西收到西蒙斯和菲兹的通知，赶了过来用波震制服了机器人梅。
菲尔和黛西救出了比利，比利带着《黑暗之书》离开，受伤的机器人梅利用比利的善意打晕了比利拿到书，随后躲在暗处的博士把书带走了，但是他抛弃了受伤的机器人梅。
神盾局销毁了艾达和博士的机器人，但是因为没有找到梅，他们还是保存机器人梅的完好，希望早日找到真正的梅。
因为拿到了《黑暗之书》，博士和艾文诺夫喝酒庆祝，原来艾文诺夫注意到了本应死去的菲尔现在却无处不在，他认为菲尔是异人族的起源，他期望得到菲尔的下落并杀了菲尔，所以才和博士合作拿到《黑暗之书》。
