亚历克斯给梦游者号援助舰队发了无线电，他们将进行一些小小的制动操作，让梦游者号有足够的空气离开。奈奥尔听到亚历克斯的这一重大举措，忍不住夸亚历克斯做得好，更感谢他救了那么多人。
在亚历克斯汇报了梦游者号的事情之后，奈奥尔询问亚历克斯，有关罗西南多号的情况，亚历克斯遗憾地告诉奈奥尔，鱼雷的很多残片都击中了下层舱体，船尾还有很多破损，让奈奥尔跟他一起修理一下。
就在亚历克斯跟奈奥尔说明罗西南多号的问题之时，无意间发现他们想要杀死的那个原分子病毒就在罗西南多号的仓库里，而它很可能是在亚历克斯他们之前逼它入温室穹顶之时，跑到了他们的仓库之内。虽然不知道那个原分子病毒如何活了过来，但霍顿认为他们现在的唯一目的就是将它杀死，并为此不惜一切代价。
霍顿和艾莫斯前往仓库，找寻那个原分子病毒，而此时原分子病毒正往自己的胸口拔掉它的一个装置，霍顿只好命令艾莫斯跟他一起向原分子病毒开火。火拼了一阵之后，那个原分子病毒用一个货柜把霍顿钉在了墙上，而艾莫斯却没办法打开磁力锁。就在艾莫斯试图打开磁力锁之时，霍顿发现艾莫斯的面罩在漏气，他只得命令艾莫斯离开仓库。
艾莫斯走后，那个原分子病毒突然觉得霍顿不构成威胁，所以没有再向霍顿靠近。孟博士查到，那个原分子病毒从自己胸口拿走的是自毁装置，是某种指令控制装置，所以他认为那个原分子病毒也并非愚蠢的生物。亚历克斯认为孟博士是马后炮，忍不住跟他吵了起来，奈奥尔只得勒令他们停止争吵先把那个原分子病毒赶走再说。
就在争吵的同时，原分子病毒拼命地砸舱门，奈奥尔这才明白过来，原分子病毒是靠辐射生存的，而它正想去反应堆。奈奥尔他们在原分子病毒砸舱门之时，讨论办法除掉原分子病毒，亚历克斯想要高速旋转把原分子病毒跌出他们的飞船，可奈奥尔不答应，因为这样做了霍顿会被撕成两半。
孟博士认为原分子病毒以前是个人，就一定会局限性，所以他建议电击它，可亚历克斯却认为原分子病毒连子弹都不怕，电击根本对它起不了作用。艾莫斯讲了他之前做学徒的一个故事，想用气压炸开原分子病毒，可奈奥尔还是因为霍顿在仓库里，而坚持不肯按照艾莫斯的方法做。
原分子病毒挖得很快，几乎已经把舱门的一层夹板给掀掉了，亚历克斯这才想到关闭引擎拖延时间。关闭引擎之后，原分子病毒果真不挖舱门了，可它却回头去找霍顿，逼得亚历克斯只得再开引擎。就在大家为救霍顿的事情犯难之时，孟博士通过他植物学的养分梯度想到了办法，认为他们可以找一个鱼雷的核弹头，把原分子病毒诱骗出去。
奈奥尔和孟博士带着鱼雷走出船舱，等他们拿出核弹头之时，原分子病毒果真被他们引诱了出来，而孟博士却差点把原分子病毒当成孟梅，迟迟不肯扔核弹头，到原分子病毒非常靠近他们之时，他才在奈奥尔的催促下，扔掉了核弹头，把原分子病毒摔落太空，亚历克斯再趁机销毁原分子病毒，化解了罗西南多号的危机。在霍顿得救后，奈奥尔向霍顿坦白，她并没有销毁原分子病毒样本，而是把它交给了佛瑞德。（本季终）
